Sebagai nazhir wakaf, Dompet Dhuafa juga telah memiliki beragam program wakaf yang sudah berjalan dan berkontribusi dalam hal pemberdayaan umat. Dompet Dhuafa sangat konsens membangun sumber daya manusia unggul untuk memutus rantai kemiskinan.
Diantaranya membangun rumah sakit untuk dhuafa, pendidikan berkualitas untuk dhuafa, pemberdayaan ekonomi, sarana publik dan infrastruktur sosial lainnya. Serta, Dompet Dhuafa memiliki 7 rumah sakit yang melayani dhuafa secara gratis, selain memiliki sekolah gratis dan beasiswa.