Mulanya, jemaah wanita ditempatkan pada shaf sejajar dengan laki-laki dengan komposisi 70 berbanding 30.
Namun Syekh Al Zaytun lantas menegur panitia shalat Jumat dan meminta agar komposisi diubah menjadi 50-50.
Yakni barisan santri Rijal berjajar pada shaf mulai dari belakang imam ke sisi kanan. Sedangkan santri Nisa berjajar mulai dari belakang imam ke sisi kiri.
Meski menempatkan shaf sejajar, jemaah masih berjarak dan saling berjauhan. Kemudian mereka menggunakan kursi yang ditempatkan di samping sajadah.
Karena itu, shalat Jumat yang baru diterapkan di Mahad Al Zaytun tersebut menjadi polemik di masyarakat karena menempatkan wanita sejajar dengan pria dan tanpa sekat.