Ia kemudian pindah bersama keluarganya ke kampung halaman ibunya di Cumiana, Italia pada tahun 1998.
BACA JUGA:Jens Raven Gacor Bersama Timnas Indonesia U19, Merasa Terhomat Jika STY Panggil Bela Timnas Senior
Karena Emilio Audero lahir di Indonesia dari ayah Indonesia dan ibu Italia, ia sebenanrnya tetap memenuhi syarat untuk bermain untuk tim nasional senior Italia dan Indonesia .
Sejak 2012, ia telah mewakili Italia di semua level pemuda dari level U-15 hingga U-21 .
Bersama tim Italia U-17, ia ikut serta dalam Kejuaraan Eropa U-17 UEFA 2013.
Ia tidak dimasukkan dalam skuad Italia U-20 untuk Piala Dunia U-20 FIFA 2017 di Korea Selatan karena Juventus ingin ia tetap memenuhi syarat untuk bermain untuk klub tersebut.
Pada 4 September 2017, ia melakukan debutnya bersama tim Italia U-21 di bawah asuhan Luigi Di Biagio dalam kemenangan persahabatan 4–1 melawan Slovenia di Cittadella.