Sesampai di lokasi kejadian, diduga mobil mengalami aquaplaning serta kehilangan kendali dan kemudian menghantam pembatas di kiri jalan.
Akibat hal tersebut, Fortuner putih yang ditumpangi Gus Aab berhenti dalam kondisi terbalik di parit pinggir jalan tol.
Dalam musibah itu terdapat dua korban lainnya selain Gus Aab yaitu Muhammad Baidowi dan Hisyam Abdullah.
Kecelakaan itu juga disampaikan oleh KH Yahya Cholil Staquf atau Gus Yahya selaku Ketua Umum PBNU dalam memberikan sambutan saat pembukaan Konbes NU di Pesantren Al-Munawwir Krapyak, Senin 29 Januari lalu.
Gus Yahya memohon doa kepada para hadirin untuk mendoakan Gus Aab yang mengalami musibah.
"Saya dalam kesempatan ini ingin memohon bantuan doa dari bapak dan ibu sekalian, tadi malam saudara kita Pimpinan Ketua Lembaga Dakwah PBNU KH Abdullah Syamsul Arifin mengalami musibah dalam perjalanan menuju Konbes ini. Semoga beliau segera dikaruniai segera pulih," ujar Gus Yahya.